Brezilya’nın ev sahipliğindeki 2014 Dünya Kupası’nda Cezayir Milli Takımı’nın teknik direktörüydü. Almanya’ya uzatmalarda 2-1 yenilerek son 16 turunda elendikleri maçın ardından futbolcularına sarılarak hüngür hüngür ağladı. Japonya Milli Takımı elemeleri geçerek 2018 Dünya Kupası’na katılmaya hak kazandı. Ancak Halilhodzic bu başarısına rağmen görevden alındı. Tokyo’dan ayrılırken, tercümanıyla birlikte kameraların önünde gözyaşlarını tutamadı. Nantes teknik direktörü olarak da acı ve hüzün peşini bırakmadı. Emilano Sala’nın cesedinin bulunmasının ardından önceki günkü basın toplantısında duygu dolu anlar yaşadı. Ağlayan Halilhodzic gözyaşlarını silerek kendisini toparlamaya çalıştı.